Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSNK1EP49674 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSNK1EP49674 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSNK1EP49674 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSNK1EP49674 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSNK1EP49674 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSNK1EP49674 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSNK1EP49674 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSNK1EP49674 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSNK1EP49674 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSNK1EP49674 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSNK1EP49674 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSNK1EP49674 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CSNK1EP49674 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSNK1EP49674 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms