Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PXNP49023 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PXNP49023 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PXNP49023 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PXNP49023 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PXNP49023 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PXNP49023 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PXNP49023 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PXNP49023 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PXNP49023 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PXNP49023 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PXNP49023 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PXNP49023 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PXNP49023 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PXNP49023 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PXNP49023 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PXNP49023 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PXNP49023 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PXNP49023 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PXNP49023 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PXNP49023 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PXNP49023 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PXNP49023 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PXNP49023 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PXNP49023 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PXNP49023 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PXNP49023 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PXNP49023 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PXNP49023 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PXNP49023 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PXNP49023 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PXNP49023 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PXNP49023 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PXNP49023 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PXNP49023 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PXNP49023 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PXNP49023 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PXNP49023 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PXNP49023 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PXNP49023 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PXNP49023 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PXNP49023 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PXNP49023 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PXNP49023 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PXNP49023 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PXNP49023 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PXNP49023 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PXNP49023 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PXNP49023 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PXNP49023 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PXNP49023 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PXNP49023 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PXNP49023 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PXNP49023 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PXNP49023 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PXNP49023 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PXNP49023 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PXNP49023 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PXNP49023 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PXNP49023 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PXNP49023 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PXNP49023 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PXNP49023 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PXNP49023 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PXNP49023 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PXNP49023 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PXNP49023 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PXNP49023 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PXNP49023 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PXNP49023 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PXNP49023 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PXNP49023 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PXNP49023 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PXNP49023 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PXNP49023 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PXNP49023 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PXNP49023 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PXNP49023 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PXNP49023 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PXNP49023 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PXNP49023 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PXNP49023 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PXNP49023 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PXNP49023 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PXNP49023 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PXNP49023 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PXNP49023 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PXNP49023 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PXNP49023 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PXNP49023 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PXNP49023 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PXNP49023 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PXNP49023 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PXNP49023 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PXNP49023 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PXNP49023 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PXNP49023 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PXNP49023 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PXNP49023 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PXNP49023 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms