Protein–RNA interactions for Protein: P47736

RAP1GAP, Rap1 GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GAPP47736 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAP1GAPP47736 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAP1GAPP47736 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAP1GAPP47736 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAP1GAPP47736 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAP1GAPP47736 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAP1GAPP47736 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAP1GAPP47736 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAP1GAPP47736 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAP1GAPP47736 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAP1GAPP47736 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAP1GAPP47736 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RAP1GAPP47736 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAP1GAPP47736 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAP1GAPP47736 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAP1GAPP47736 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms