Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPR4P46093 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPR4P46093 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPR4P46093 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPR4P46093 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPR4P46093 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPR4P46093 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPR4P46093 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPR4P46093 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPR4P46093 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR4P46093 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR4P46093 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR4P46093 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPR4P46093 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPR4P46093 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPR4P46093 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GPR4P46093 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPR4P46093 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPR4P46093 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPR4P46093 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPR4P46093 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPR4P46093 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPR4P46093 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPR4P46093 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPR4P46093 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPR4P46093 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPR4P46093 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR4P46093 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR4P46093 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR4P46093 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR4P46093 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR4P46093 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR4P46093 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR4P46093 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR4P46093 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR4P46093 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR4P46093 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR4P46093 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR4P46093 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR4P46093 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR4P46093 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR4P46093 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR4P46093 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR4P46093 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR4P46093 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR4P46093 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR4P46093 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR4P46093 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR4P46093 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR4P46093 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR4P46093 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR4P46093 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR4P46093 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR4P46093 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR4P46093 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR4P46093 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR4P46093 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR4P46093 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR4P46093 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR4P46093 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR4P46093 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR4P46093 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR4P46093 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR4P46093 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR4P46093 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR4P46093 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPR4P46093 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPR4P46093 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPR4P46093 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR4P46093 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR4P46093 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR4P46093 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR4P46093 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR4P46093 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR4P46093 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR4P46093 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR4P46093 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR4P46093 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR4P46093 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR4P46093 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR4P46093 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR4P46093 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR4P46093 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR4P46093 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR4P46093 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR4P46093 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR4P46093 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR4P46093 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR4P46093 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR4P46093 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR4P46093 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR4P46093 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR4P46093 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR4P46093 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR4P46093 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR4P46093 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR4P46093 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR4P46093 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR4P46093 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR4P46093 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms