Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTGER2P43116 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTGER2P43116 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTGER2P43116 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTGER2P43116 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTGER2P43116 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTGER2P43116 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTGER2P43116 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTGER2P43116 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTGER2P43116 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTGER2P43116 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTGER2P43116 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTGER2P43116 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTGER2P43116 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTGER2P43116 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTGER2P43116 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTGER2P43116 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTGER2P43116 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTGER2P43116 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTGER2P43116 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
PTGER2P43116 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PTGER2P43116 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
PTGER2P43116 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTGER2P43116 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTGER2P43116 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTGER2P43116 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PTGER2P43116 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTGER2P43116 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTGER2P43116 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PTGER2P43116 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTGER2P43116 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTGER2P43116 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTGER2P43116 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTGER2P43116 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms