Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTHFRP42898 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFRP42898 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFRP42898 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFRP42898 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFRP42898 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFRP42898 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFRP42898 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFRP42898 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFRP42898 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFRP42898 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFRP42898 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFRP42898 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFRP42898 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFRP42898 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTHFRP42898 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTHFRP42898 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTHFRP42898 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTHFRP42898 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTHFRP42898 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MTHFRP42898 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTHFRP42898 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTHFRP42898 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTHFRP42898 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTHFRP42898 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTHFRP42898 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTHFRP42898 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTHFRP42898 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTHFRP42898 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MTHFRP42898 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTHFRP42898 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTHFRP42898 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTHFRP42898 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTHFRP42898 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTHFRP42898 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFRP42898 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFRP42898 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFRP42898 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFRP42898 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFRP42898 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFRP42898 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFRP42898 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTHFRP42898 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTHFRP42898 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFRP42898 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFRP42898 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFRP42898 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFRP42898 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFRP42898 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFRP42898 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MTHFRP42898 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFRP42898 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFRP42898 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFRP42898 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFRP42898 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFRP42898 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms