Protein–RNA interactions for Protein: P41597

CCR2, C-C chemokine receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR2P41597 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCR2P41597 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCR2P41597 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCR2P41597 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCR2P41597 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCR2P41597 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCR2P41597 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCR2P41597 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCR2P41597 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCR2P41597 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCR2P41597 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCR2P41597 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCR2P41597 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCR2P41597 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCR2P41597 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCR2P41597 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCR2P41597 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCR2P41597 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCR2P41597 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCR2P41597 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCR2P41597 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCR2P41597 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCR2P41597 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCR2P41597 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCR2P41597 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCR2P41597 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCR2P41597 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCR2P41597 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCR2P41597 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCR2P41597 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCR2P41597 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCR2P41597 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCR2P41597 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCR2P41597 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCR2P41597 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCR2P41597 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCR2P41597 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCR2P41597 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CCR2P41597 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCR2P41597 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCR2P41597 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCR2P41597 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCR2P41597 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCR2P41597 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCR2P41597 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCR2P41597 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCR2P41597 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCR2P41597 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCR2P41597 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCR2P41597 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCR2P41597 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCR2P41597 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCR2P41597 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCR2P41597 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCR2P41597 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCR2P41597 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCR2P41597 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCR2P41597 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCR2P41597 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCR2P41597 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCR2P41597 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCR2P41597 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCR2P41597 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCR2P41597 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCR2P41597 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCR2P41597 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCR2P41597 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCR2P41597 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCR2P41597 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCR2P41597 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCR2P41597 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCR2P41597 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCR2P41597 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCR2P41597 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCR2P41597 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCR2P41597 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCR2P41597 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCR2P41597 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCR2P41597 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCR2P41597 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCR2P41597 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCR2P41597 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCR2P41597 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCR2P41597 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCR2P41597 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCR2P41597 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCR2P41597 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCR2P41597 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCR2P41597 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCR2P41597 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCR2P41597 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCR2P41597 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCR2P41597 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCR2P41597 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCR2P41597 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCR2P41597 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCR2P41597 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCR2P41597 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCR2P41597 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCR2P41597 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms