Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2IP36954 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2IP36954 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2IP36954 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR2IP36954 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2IP36954 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms