Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACVR1BP36896 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACVR1BP36896 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACVR1BP36896 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACVR1BP36896 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1BP36896 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms