Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL4P36578 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL4P36578 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL4P36578 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL4P36578 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL4P36578 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL4P36578 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL4P36578 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL4P36578 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL4P36578 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL4P36578 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL4P36578 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL4P36578 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL4P36578 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL4P36578 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL4P36578 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL4P36578 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL4P36578 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL4P36578 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL4P36578 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL4P36578 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL4P36578 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL4P36578 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL4P36578 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL4P36578 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL4P36578 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL4P36578 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL4P36578 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL4P36578 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL4P36578 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL4P36578 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL4P36578 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL4P36578 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL4P36578 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL4P36578 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL4P36578 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL4P36578 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL4P36578 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL4P36578 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL4P36578 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL4P36578 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL4P36578 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL4P36578 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL4P36578 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL4P36578 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL4P36578 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL4P36578 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL4P36578 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL4P36578 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL4P36578 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL4P36578 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL4P36578 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL4P36578 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL4P36578 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL4P36578 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL4P36578 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL4P36578 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL4P36578 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL4P36578 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL4P36578 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL4P36578 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL4P36578 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL4P36578 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL4P36578 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL4P36578 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL4P36578 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL4P36578 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL4P36578 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL4P36578 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL4P36578 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL4P36578 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL4P36578 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL4P36578 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL4P36578 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL4P36578 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL4P36578 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL4P36578 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL4P36578 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL4P36578 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL4P36578 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL4P36578 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL4P36578 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL4P36578 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL4P36578 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL4P36578 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL4P36578 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL4P36578 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL4P36578 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL4P36578 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL4P36578 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL4P36578 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL4P36578 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL4P36578 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL4P36578 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL4P36578 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL4P36578 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL4P36578 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL4P36578 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL4P36578 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL4P36578 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms