Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SFTPDP35247 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPDP35247 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFTPDP35247 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPDP35247 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFTPDP35247 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms