Protein–RNA interactions for Protein: P35219

CA8, Carbonic anhydrase-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA8P35219 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CA8P35219 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CA8P35219 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CA8P35219 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CA8P35219 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CA8P35219 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CA8P35219 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CA8P35219 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CA8P35219 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CA8P35219 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CA8P35219 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CA8P35219 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CA8P35219 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CA8P35219 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CA8P35219 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CA8P35219 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CA8P35219 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CA8P35219 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CA8P35219 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CA8P35219 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CA8P35219 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CA8P35219 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CA8P35219 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CA8P35219 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CA8P35219 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CA8P35219 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CA8P35219 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CA8P35219 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CA8P35219 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CA8P35219 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CA8P35219 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CA8P35219 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CA8P35219 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CA8P35219 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CA8P35219 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CA8P35219 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CA8P35219 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CA8P35219 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CA8P35219 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CA8P35219 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CA8P35219 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CA8P35219 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CA8P35219 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CA8P35219 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CA8P35219 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CA8P35219 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CA8P35219 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CA8P35219 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CA8P35219 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CA8P35219 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CA8P35219 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CA8P35219 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CA8P35219 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CA8P35219 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CA8P35219 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CA8P35219 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CA8P35219 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CA8P35219 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CA8P35219 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CA8P35219 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CA8P35219 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CA8P35219 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CA8P35219 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CA8P35219 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CA8P35219 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CA8P35219 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CA8P35219 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CA8P35219 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CA8P35219 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CA8P35219 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CA8P35219 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CA8P35219 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CA8P35219 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CA8P35219 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CA8P35219 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CA8P35219 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CA8P35219 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CA8P35219 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CA8P35219 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CA8P35219 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CA8P35219 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CA8P35219 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CA8P35219 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CA8P35219 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CA8P35219 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CA8P35219 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CA8P35219 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CA8P35219 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CA8P35219 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CA8P35219 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CA8P35219 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CA8P35219 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CA8P35219 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CA8P35219 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CA8P35219 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CA8P35219 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CA8P35219 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CA8P35219 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CA8P35219 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CA8P35219 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms