Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPL9P32969 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPL9P32969 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPL9P32969 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPL9P32969 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPL9P32969 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPL9P32969 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPL9P32969 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPL9P32969 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPL9P32969 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPL9P32969 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPL9P32969 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPL9P32969 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPL9P32969 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPL9P32969 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPL9P32969 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPL9P32969 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPL9P32969 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPL9P32969 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RPL9P32969 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPL9P32969 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPL9P32969 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPL9P32969 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPL9P32969 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPL9P32969 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPL9P32969 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPL9P32969 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPL9P32969 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPL9P32969 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPL9P32969 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPL9P32969 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPL9P32969 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPL9P32969 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPL9P32969 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPL9P32969 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPL9P32969 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPL9P32969 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPL9P32969 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPL9P32969 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPL9P32969 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPL9P32969 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPL9P32969 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPL9P32969 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPL9P32969 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPL9P32969 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPL9P32969 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPL9P32969 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPL9P32969 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RPL9P32969 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPL9P32969 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPL9P32969 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPL9P32969 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPL9P32969 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPL9P32969 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPL9P32969 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPL9P32969 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPL9P32969 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPL9P32969 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPL9P32969 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPL9P32969 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPL9P32969 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPL9P32969 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPL9P32969 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPL9P32969 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPL9P32969 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPL9P32969 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPL9P32969 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPL9P32969 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPL9P32969 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPL9P32969 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPL9P32969 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPL9P32969 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPL9P32969 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RPL9P32969 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPL9P32969 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RPL9P32969 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPL9P32969 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RPL9P32969 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPL9P32969 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPL9P32969 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPL9P32969 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPL9P32969 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPL9P32969 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPL9P32969 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPL9P32969 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPL9P32969 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPL9P32969 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPL9P32969 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPL9P32969 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPL9P32969 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPL9P32969 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPL9P32969 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPL9P32969 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPL9P32969 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPL9P32969 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RPL9P32969 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPL9P32969 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPL9P32969 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPL9P32969 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPL9P32969 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms