Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHATP28329 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHATP28329 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHATP28329 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHATP28329 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHATP28329 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHATP28329 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHATP28329 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHATP28329 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHATP28329 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHATP28329 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHATP28329 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHATP28329 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHATP28329 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHATP28329 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHATP28329 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHATP28329 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHATP28329 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHATP28329 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHATP28329 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHATP28329 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHATP28329 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHATP28329 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHATP28329 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHATP28329 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHATP28329 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHATP28329 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHATP28329 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHATP28329 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHATP28329 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHATP28329 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHATP28329 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHATP28329 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHATP28329 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHATP28329 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHATP28329 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHATP28329 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHATP28329 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHATP28329 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHATP28329 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHATP28329 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHATP28329 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHATP28329 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHATP28329 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHATP28329 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHATP28329 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHATP28329 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHATP28329 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHATP28329 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHATP28329 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHATP28329 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHATP28329 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHATP28329 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHATP28329 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHATP28329 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHATP28329 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHATP28329 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHATP28329 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHATP28329 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHATP28329 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHATP28329 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHATP28329 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHATP28329 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHATP28329 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHATP28329 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHATP28329 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHATP28329 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHATP28329 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHATP28329 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHATP28329 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHATP28329 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHATP28329 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHATP28329 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHATP28329 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHATP28329 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHATP28329 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHATP28329 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHATP28329 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHATP28329 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHATP28329 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHATP28329 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHATP28329 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHATP28329 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHATP28329 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHATP28329 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHATP28329 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHATP28329 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHATP28329 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHATP28329 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHATP28329 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHATP28329 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHATP28329 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHATP28329 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHATP28329 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHATP28329 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHATP28329 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHATP28329 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHATP28329 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHATP28329 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHATP28329 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms