Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TMOD1P28289 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD1P28289 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD1P28289 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD1P28289 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD1P28289 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD1P28289 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMOD1P28289 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMOD1P28289 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD1P28289 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD1P28289 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMOD1P28289 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMOD1P28289 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMOD1P28289 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMOD1P28289 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD1P28289 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD1P28289 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD1P28289 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD1P28289 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD1P28289 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD1P28289 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD1P28289 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD1P28289 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD1P28289 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD1P28289 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD1P28289 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD1P28289 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD1P28289 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD1P28289 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMOD1P28289 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD1P28289 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD1P28289 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD1P28289 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD1P28289 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD1P28289 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD1P28289 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD1P28289 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD1P28289 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 339.6 ms