Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLR2AP24928 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLR2AP24928 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLR2AP24928 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLR2AP24928 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
POLR2AP24928 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLR2AP24928 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLR2AP24928 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
POLR2AP24928 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLR2AP24928 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLR2AP24928 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLR2AP24928 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
POLR2AP24928 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
POLR2AP24928 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
POLR2AP24928 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLR2AP24928 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLR2AP24928 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLR2AP24928 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLR2AP24928 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLR2AP24928 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
POLR2AP24928 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLR2AP24928 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLR2AP24928 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR2AP24928 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR2AP24928 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR2AP24928 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR2AP24928 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR2AP24928 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR2AP24928 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLR2AP24928 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLR2AP24928 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR2AP24928 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR2AP24928 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR2AP24928 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR2AP24928 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR2AP24928 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR2AP24928 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR2AP24928 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR2AP24928 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR2AP24928 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR2AP24928 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR2AP24928 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR2AP24928 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR2AP24928 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR2AP24928 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR2AP24928 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR2AP24928 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR2AP24928 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR2AP24928 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLR2AP24928 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
POLR2AP24928 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
POLR2AP24928 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR2AP24928 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR2AP24928 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR2AP24928 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR2AP24928 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR2AP24928 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR2AP24928 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR2AP24928 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms