Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF4P23510 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF4P23510 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF4P23510 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF4P23510 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF4P23510 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF4P23510 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF4P23510 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF4P23510 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF4P23510 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF4P23510 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF4P23510 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF4P23510 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF4P23510 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF4P23510 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms