Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPREP23469 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPREP23469 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPREP23469 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPREP23469 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPREP23469 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPREP23469 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPREP23469 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPREP23469 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPREP23469 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPREP23469 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPREP23469 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPREP23469 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPREP23469 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPREP23469 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPREP23469 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPREP23469 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPREP23469 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPREP23469 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPREP23469 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPREP23469 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPREP23469 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPREP23469 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPREP23469 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPREP23469 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPREP23469 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPREP23469 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPREP23469 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPREP23469 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPREP23469 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPREP23469 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPREP23469 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPREP23469 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPREP23469 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPREP23469 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPREP23469 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPREP23469 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPREP23469 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPREP23469 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPREP23469 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPREP23469 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPREP23469 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPREP23469 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPREP23469 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPREP23469 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPREP23469 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPREP23469 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPREP23469 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPREP23469 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPREP23469 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPREP23469 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPREP23469 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPREP23469 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPREP23469 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPREP23469 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPREP23469 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPREP23469 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPREP23469 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPREP23469 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPREP23469 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPREP23469 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPREP23469 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPREP23469 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPREP23469 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPREP23469 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPREP23469 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPREP23469 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPREP23469 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPREP23469 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPREP23469 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPREP23469 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPREP23469 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPREP23469 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPREP23469 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPREP23469 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPREP23469 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPREP23469 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPREP23469 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPREP23469 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPREP23469 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPREP23469 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPREP23469 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPREP23469 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPREP23469 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPREP23469 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPREP23469 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPREP23469 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPREP23469 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPREP23469 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPREP23469 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPREP23469 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPREP23469 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPREP23469 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPREP23469 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPREP23469 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPREP23469 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPREP23469 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPREP23469 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPREP23469 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPREP23469 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
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