Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF1P21359 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF1P21359 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF1P21359 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF1P21359 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF1P21359 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF1P21359 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF1P21359 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF1P21359 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF1P21359 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF1P21359 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF1P21359 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NF1P21359 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NF1P21359 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NF1P21359 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NF1P21359 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NF1P21359 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NF1P21359 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NF1P21359 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NF1P21359 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NF1P21359 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NF1P21359 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NF1P21359 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NF1P21359 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NF1P21359 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NF1P21359 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NF1P21359 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NF1P21359 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NF1P21359 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NF1P21359 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NF1P21359 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NF1P21359 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NF1P21359 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NF1P21359 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NF1P21359 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NF1P21359 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NF1P21359 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NF1P21359 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NF1P21359 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NF1P21359 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NF1P21359 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NF1P21359 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NF1P21359 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NF1P21359 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NF1P21359 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NF1P21359 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NF1P21359 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NF1P21359 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NF1P21359 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NF1P21359 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NF1P21359 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NF1P21359 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NF1P21359 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NF1P21359 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NF1P21359 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NF1P21359 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NF1P21359 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NF1P21359 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NF1P21359 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NF1P21359 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NF1P21359 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NF1P21359 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NF1P21359 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NF1P21359 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NF1P21359 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NF1P21359 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NF1P21359 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NF1P21359 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NF1P21359 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NF1P21359 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NF1P21359 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NF1P21359 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NF1P21359 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NF1P21359 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NF1P21359 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NF1P21359 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NF1P21359 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NF1P21359 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NF1P21359 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NF1P21359 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NF1P21359 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NF1P21359 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NF1P21359 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NF1P21359 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NF1P21359 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NF1P21359 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NF1P21359 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NF1P21359 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NF1P21359 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NF1P21359 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NF1P21359 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NF1P21359 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NF1P21359 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NF1P21359 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NF1P21359 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NF1P21359 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NF1P21359 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NF1P21359 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NF1P21359 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NF1P21359 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms