Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK11BP21127 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK11BP21127 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK11BP21127 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK11BP21127 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK11BP21127 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDK11BP21127 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK11BP21127 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms