Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
TRHP20396 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
TRHP20396 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
TRHP20396 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
TRHP20396 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
TRHP20396 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
TRHP20396 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
TRHP20396 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
TRHP20396 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
TRHP20396 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TRHP20396 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TRHP20396 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
TRHP20396 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
TRHP20396 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.77■■■■■ 4.44
TRHP20396 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
TRHP20396 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
TRHP20396 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
TRHP20396 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TRHP20396 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
TRHP20396 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
TRHP20396 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
TRHP20396 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TRHP20396 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TRHP20396 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TRHP20396 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
TRHP20396 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
TRHP20396 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
TRHP20396 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
TRHP20396 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
TRHP20396 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
TRHP20396 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
TRHP20396 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TRHP20396 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TRHP20396 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TRHP20396 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TRHP20396 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
TRHP20396 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TRHP20396 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
TRHP20396 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TRHP20396 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
TRHP20396 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TRHP20396 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TRHP20396 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
TRHP20396 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TRHP20396 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TRHP20396 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
TRHP20396 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.51■■■■■ 4.4
TRHP20396 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
TRHP20396 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
TRHP20396 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
TRHP20396 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
TRHP20396 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TRHP20396 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TRHP20396 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
TRHP20396 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC42.45■■■■■ 4.39
TRHP20396 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
TRHP20396 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
TRHP20396 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
TRHP20396 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
TRHP20396 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TRHP20396 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
TRHP20396 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
TRHP20396 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
TRHP20396 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
TRHP20396 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
TRHP20396 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
TRHP20396 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TRHP20396 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
TRHP20396 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
TRHP20396 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
TRHP20396 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
TRHP20396 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TRHP20396 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
TRHP20396 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
TRHP20396 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
TRHP20396 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
TRHP20396 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
TRHP20396 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TRHP20396 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TRHP20396 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
TRHP20396 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
TRHP20396 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
TRHP20396 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TRHP20396 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TRHP20396 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
TRHP20396 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TRHP20396 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TRHP20396 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
TRHP20396 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
TRHP20396 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
TRHP20396 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TRHP20396 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TRHP20396 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TRHP20396 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TRHP20396 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TRHP20396 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TRHP20396 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
TRHP20396 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.08■■■■■ 4.33
TRHP20396 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TRHP20396 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms