Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB3AP20336 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3AP20336 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3AP20336 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms