Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SDSP20132 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SDSP20132 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SDSP20132 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SDSP20132 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SDSP20132 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SDSP20132 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SDSP20132 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SDSP20132 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SDSP20132 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SDSP20132 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SDSP20132 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SDSP20132 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SDSP20132 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SDSP20132 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SDSP20132 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SDSP20132 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SDSP20132 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SDSP20132 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SDSP20132 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SDSP20132 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SDSP20132 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SDSP20132 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SDSP20132 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SDSP20132 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SDSP20132 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SDSP20132 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SDSP20132 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SDSP20132 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SDSP20132 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SDSP20132 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SDSP20132 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SDSP20132 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SDSP20132 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SDSP20132 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SDSP20132 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SDSP20132 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SDSP20132 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SDSP20132 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SDSP20132 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SDSP20132 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SDSP20132 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SDSP20132 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SDSP20132 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SDSP20132 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SDSP20132 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SDSP20132 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SDSP20132 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SDSP20132 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SDSP20132 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SDSP20132 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SDSP20132 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SDSP20132 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SDSP20132 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SDSP20132 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SDSP20132 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SDSP20132 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SDSP20132 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SDSP20132 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SDSP20132 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SDSP20132 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SDSP20132 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SDSP20132 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SDSP20132 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SDSP20132 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SDSP20132 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SDSP20132 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SDSP20132 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SDSP20132 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SDSP20132 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SDSP20132 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SDSP20132 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SDSP20132 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SDSP20132 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SDSP20132 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SDSP20132 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SDSP20132 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SDSP20132 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SDSP20132 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SDSP20132 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SDSP20132 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SDSP20132 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
SDSP20132 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SDSP20132 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SDSP20132 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SDSP20132 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SDSP20132 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SDSP20132 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SDSP20132 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SDSP20132 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SDSP20132 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SDSP20132 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SDSP20132 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SDSP20132 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SDSP20132 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SDSP20132 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SDSP20132 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SDSP20132 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SDSP20132 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SDSP20132 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms