Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC3P19447 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERCC3P19447 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC3P19447 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC3P19447 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC3P19447 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC3P19447 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC3P19447 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC3P19447 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC3P19447 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC3P19447 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC3P19447 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERCC3P19447 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERCC3P19447 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC3P19447 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC3P19447 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC3P19447 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms