Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2EP19388 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2EP19388 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2EP19388 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2EP19388 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2EP19388 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2EP19388 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2EP19388 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2EP19388 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2EP19388 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2EP19388 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2EP19388 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR2EP19388 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2EP19388 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2EP19388 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2EP19388 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2EP19388 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2EP19388 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2EP19388 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2EP19388 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2EP19388 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR2EP19388 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2EP19388 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2EP19388 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2EP19388 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2EP19388 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2EP19388 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2EP19388 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2EP19388 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2EP19388 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2EP19388 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms