Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB4P17483 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB4P17483 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms