Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPGDP15428 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPGDP15428 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPGDP15428 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPGDP15428 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPGDP15428 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPGDP15428 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HPGDP15428 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPGDP15428 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPGDP15428 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPGDP15428 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPGDP15428 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPGDP15428 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPGDP15428 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPGDP15428 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPGDP15428 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HPGDP15428 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HPGDP15428 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPGDP15428 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPGDP15428 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPGDP15428 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPGDP15428 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPGDP15428 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPGDP15428 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPGDP15428 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPGDP15428 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPGDP15428 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPGDP15428 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPGDP15428 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPGDP15428 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPGDP15428 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPGDP15428 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPGDP15428 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPGDP15428 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPGDP15428 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPGDP15428 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPGDP15428 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPGDP15428 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPGDP15428 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPGDP15428 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPGDP15428 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPGDP15428 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPGDP15428 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPGDP15428 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPGDP15428 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPGDP15428 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPGDP15428 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPGDP15428 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPGDP15428 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPGDP15428 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPGDP15428 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HPGDP15428 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPGDP15428 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPGDP15428 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPGDP15428 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPGDP15428 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPGDP15428 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPGDP15428 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPGDP15428 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPGDP15428 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPGDP15428 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPGDP15428 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPGDP15428 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPGDP15428 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPGDP15428 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPGDP15428 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPGDP15428 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPGDP15428 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPGDP15428 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPGDP15428 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPGDP15428 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HPGDP15428 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPGDP15428 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HPGDP15428 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPGDP15428 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPGDP15428 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPGDP15428 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HPGDP15428 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPGDP15428 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPGDP15428 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPGDP15428 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPGDP15428 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPGDP15428 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPGDP15428 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPGDP15428 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPGDP15428 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPGDP15428 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPGDP15428 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPGDP15428 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPGDP15428 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPGDP15428 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPGDP15428 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPGDP15428 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPGDP15428 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPGDP15428 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HPGDP15428 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HPGDP15428 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPGDP15428 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPGDP15428 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPGDP15428 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms