Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGA4P13612 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGA4P13612 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGA4P13612 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA4P13612 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA4P13612 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA4P13612 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA4P13612 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA4P13612 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ITGA4P13612 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGA4P13612 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGA4P13612 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGA4P13612 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA4P13612 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA4P13612 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA4P13612 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA4P13612 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA4P13612 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA4P13612 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA4P13612 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA4P13612 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGA4P13612 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGA4P13612 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGA4P13612 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGA4P13612 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA4P13612 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA4P13612 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA4P13612 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA4P13612 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA4P13612 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA4P13612 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA4P13612 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA4P13612 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA4P13612 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms