Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms