Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PABPC1P11940 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PABPC1P11940 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PABPC1P11940 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PABPC1P11940 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PABPC1P11940 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PABPC1P11940 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PABPC1P11940 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PABPC1P11940 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PABPC1P11940 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PABPC1P11940 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PABPC1P11940 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PABPC1P11940 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PABPC1P11940 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PABPC1P11940 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PABPC1P11940 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PABPC1P11940 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC1P11940 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPC1P11940 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC1P11940 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC1P11940 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC1P11940 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC1P11940 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.6 ms