Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PYGBP11216 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PYGBP11216 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PYGBP11216 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PYGBP11216 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PYGBP11216 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PYGBP11216 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PYGBP11216 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYGBP11216 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PYGBP11216 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYGBP11216 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYGBP11216 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYGBP11216 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYGBP11216 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYGBP11216 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PYGBP11216 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PYGBP11216 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PYGBP11216 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PYGBP11216 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PYGBP11216 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PYGBP11216 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PYGBP11216 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PYGBP11216 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PYGBP11216 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PYGBP11216 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PYGBP11216 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PYGBP11216 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PYGBP11216 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PYGBP11216 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PYGBP11216 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PYGBP11216 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PYGBP11216 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PYGBP11216 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PYGBP11216 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PYGBP11216 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PYGBP11216 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PYGBP11216 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PYGBP11216 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PYGBP11216 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PYGBP11216 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PYGBP11216 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PYGBP11216 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PYGBP11216 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PYGBP11216 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PYGBP11216 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PYGBP11216 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PYGBP11216 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PYGBP11216 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PYGBP11216 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PYGBP11216 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PYGBP11216 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PYGBP11216 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PYGBP11216 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PYGBP11216 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PYGBP11216 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PYGBP11216 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PYGBP11216 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PYGBP11216 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PYGBP11216 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PYGBP11216 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PYGBP11216 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PYGBP11216 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PYGBP11216 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PYGBP11216 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PYGBP11216 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PYGBP11216 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PYGBP11216 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PYGBP11216 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PYGBP11216 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PYGBP11216 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PYGBP11216 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PYGBP11216 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PYGBP11216 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PYGBP11216 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PYGBP11216 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PYGBP11216 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PYGBP11216 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PYGBP11216 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PYGBP11216 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PYGBP11216 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PYGBP11216 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PYGBP11216 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PYGBP11216 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PYGBP11216 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PYGBP11216 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PYGBP11216 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PYGBP11216 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PYGBP11216 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PYGBP11216 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PYGBP11216 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PYGBP11216 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PYGBP11216 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PYGBP11216 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PYGBP11216 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PYGBP11216 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PYGBP11216 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PYGBP11216 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PYGBP11216 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PYGBP11216 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PYGBP11216 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms