Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI4P10075 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI4P10075 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI4P10075 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI4P10075 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI4P10075 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI4P10075 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI4P10075 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI4P10075 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI4P10075 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI4P10075 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI4P10075 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI4P10075 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI4P10075 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI4P10075 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI4P10075 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI4P10075 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI4P10075 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI4P10075 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI4P10075 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI4P10075 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI4P10075 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI4P10075 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI4P10075 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI4P10075 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI4P10075 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI4P10075 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI4P10075 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI4P10075 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI4P10075 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI4P10075 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI4P10075 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI4P10075 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI4P10075 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI4P10075 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI4P10075 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI4P10075 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI4P10075 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI4P10075 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI4P10075 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI4P10075 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI4P10075 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI4P10075 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI4P10075 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI4P10075 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI4P10075 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI4P10075 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI4P10075 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI4P10075 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI4P10075 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI4P10075 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI4P10075 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI4P10075 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI4P10075 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI4P10075 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI4P10075 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI4P10075 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI4P10075 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI4P10075 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI4P10075 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI4P10075 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI4P10075 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI4P10075 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI4P10075 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI4P10075 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI4P10075 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI4P10075 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI4P10075 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI4P10075 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI4P10075 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI4P10075 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI4P10075 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI4P10075 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI4P10075 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI4P10075 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI4P10075 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI4P10075 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI4P10075 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI4P10075 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI4P10075 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI4P10075 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI4P10075 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI4P10075 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI4P10075 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI4P10075 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI4P10075 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI4P10075 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI4P10075 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI4P10075 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI4P10075 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI4P10075 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI4P10075 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI4P10075 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI4P10075 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI4P10075 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI4P10075 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI4P10075 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI4P10075 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI4P10075 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI4P10075 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms