Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf88P0DMB2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf88P0DMB2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf88P0DMB2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C8orf88P0DMB2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms