Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
C4BP0C0L5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
C4BP0C0L5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
C4BP0C0L5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
C4BP0C0L5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
C4BP0C0L5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
C4BP0C0L5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
C4BP0C0L5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
C4BP0C0L5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
C4BP0C0L5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
C4BP0C0L5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
C4BP0C0L5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
C4BP0C0L5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
C4BP0C0L5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
C4BP0C0L5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
C4BP0C0L5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
C4BP0C0L5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
C4BP0C0L5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
C4BP0C0L5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
C4BP0C0L5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
C4BP0C0L5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
C4BP0C0L5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
C4BP0C0L5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
C4BP0C0L5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
C4BP0C0L5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
C4BP0C0L5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
C4BP0C0L5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
C4BP0C0L5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
C4BP0C0L5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
C4BP0C0L5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
C4BP0C0L5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
C4BP0C0L5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
C4BP0C0L5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
C4BP0C0L5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
C4BP0C0L5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
C4BP0C0L5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
C4BP0C0L5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
C4BP0C0L5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
C4BP0C0L5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
C4BP0C0L5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
C4BP0C0L5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
C4BP0C0L5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
C4BP0C0L5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
C4BP0C0L5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
C4BP0C0L5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C4BP0C0L5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
C4BP0C0L5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
C4BP0C0L5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
C4BP0C0L5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
C4BP0C0L5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
C4BP0C0L5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.81■■■■□ 3
C4BP0C0L5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
C4BP0C0L5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
C4BP0C0L5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
C4BP0C0L5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
C4BP0C0L5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
C4BP0C0L5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
C4BP0C0L5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
C4BP0C0L5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.79■■■■□ 3
C4BP0C0L5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
C4BP0C0L5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
C4BP0C0L5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.78■■■■□ 3
C4BP0C0L5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
C4BP0C0L5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
C4BP0C0L5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
C4BP0C0L5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
C4BP0C0L5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
C4BP0C0L5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
C4BP0C0L5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
C4BP0C0L5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
C4BP0C0L5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
C4BP0C0L5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
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