Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CENPBP07199 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CENPBP07199 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CENPBP07199 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CENPBP07199 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CENPBP07199 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CENPBP07199 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CENPBP07199 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CENPBP07199 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CENPBP07199 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CENPBP07199 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CENPBP07199 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CENPBP07199 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CENPBP07199 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CENPBP07199 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CENPBP07199 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CENPBP07199 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CENPBP07199 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CENPBP07199 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CENPBP07199 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CENPBP07199 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CENPBP07199 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
CENPBP07199 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CENPBP07199 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CENPBP07199 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CENPBP07199 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CENPBP07199 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CENPBP07199 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CENPBP07199 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CENPBP07199 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CENPBP07199 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CENPBP07199 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CENPBP07199 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CENPBP07199 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CENPBP07199 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CENPBP07199 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CENPBP07199 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CENPBP07199 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CENPBP07199 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CENPBP07199 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CENPBP07199 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CENPBP07199 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CENPBP07199 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CENPBP07199 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CENPBP07199 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CENPBP07199 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CENPBP07199 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CENPBP07199 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CENPBP07199 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CENPBP07199 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CENPBP07199 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CENPBP07199 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CENPBP07199 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CENPBP07199 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CENPBP07199 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CENPBP07199 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CENPBP07199 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CENPBP07199 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CENPBP07199 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CENPBP07199 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CENPBP07199 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CENPBP07199 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CENPBP07199 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CENPBP07199 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CENPBP07199 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CENPBP07199 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CENPBP07199 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CENPBP07199 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CENPBP07199 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CENPBP07199 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CENPBP07199 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CENPBP07199 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CENPBP07199 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CENPBP07199 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CENPBP07199 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CENPBP07199 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CENPBP07199 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CENPBP07199 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CENPBP07199 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CENPBP07199 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CENPBP07199 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CENPBP07199 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CENPBP07199 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CENPBP07199 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CENPBP07199 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CENPBP07199 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CENPBP07199 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CENPBP07199 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CENPBP07199 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CENPBP07199 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CENPBP07199 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CENPBP07199 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CENPBP07199 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CENPBP07199 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CENPBP07199 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CENPBP07199 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CENPBP07199 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CENPBP07199 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CENPBP07199 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CENPBP07199 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms