Protein–RNA interactions for Protein: P06307

CCK, Cholecystokinin, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKP06307 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKP06307 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKP06307 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKP06307 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKP06307 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKP06307 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKP06307 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKP06307 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKP06307 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKP06307 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKP06307 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKP06307 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKP06307 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKP06307 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKP06307 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKP06307 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKP06307 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKP06307 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKP06307 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKP06307 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKP06307 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKP06307 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKP06307 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKP06307 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKP06307 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKP06307 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKP06307 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKP06307 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKP06307 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKP06307 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKP06307 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKP06307 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKP06307 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKP06307 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKP06307 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKP06307 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKP06307 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKP06307 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKP06307 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKP06307 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKP06307 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKP06307 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKP06307 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKP06307 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKP06307 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKP06307 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKP06307 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKP06307 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKP06307 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKP06307 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKP06307 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKP06307 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKP06307 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKP06307 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKP06307 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKP06307 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKP06307 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKP06307 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKP06307 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKP06307 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKP06307 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKP06307 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCKP06307 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKP06307 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKP06307 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKP06307 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKP06307 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKP06307 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKP06307 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKP06307 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKP06307 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKP06307 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKP06307 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKP06307 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKP06307 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKP06307 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKP06307 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKP06307 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKP06307 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKP06307 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCKP06307 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKP06307 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKP06307 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCKP06307 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKP06307 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKP06307 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKP06307 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKP06307 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKP06307 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKP06307 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKP06307 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKP06307 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKP06307 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKP06307 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKP06307 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCKP06307 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKP06307 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCKP06307 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKP06307 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKP06307 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms