Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBB4AP04350 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBB4AP04350 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBB4AP04350 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBB4AP04350 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBB4AP04350 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBB4AP04350 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBB4AP04350 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBB4AP04350 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBB4AP04350 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBB4AP04350 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBB4AP04350 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBB4AP04350 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBB4AP04350 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB4AP04350 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB4AP04350 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB4AP04350 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB4AP04350 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB4AP04350 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB4AP04350 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBB4AP04350 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBB4AP04350 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBB4AP04350 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TUBB4AP04350 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBB4AP04350 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB4AP04350 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TUBB4AP04350 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms