Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA2P02652 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA2P02652 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA2P02652 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA2P02652 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA2P02652 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA2P02652 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA2P02652 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA2P02652 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA2P02652 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA2P02652 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA2P02652 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA2P02652 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA2P02652 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA2P02652 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA2P02652 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA2P02652 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA2P02652 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA2P02652 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA2P02652 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA2P02652 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOA2P02652 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA2P02652 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA2P02652 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA2P02652 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA2P02652 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA2P02652 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA2P02652 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOA2P02652 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA2P02652 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA2P02652 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA2P02652 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA2P02652 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA2P02652 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA2P02652 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA2P02652 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA2P02652 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA2P02652 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA2P02652 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA2P02652 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA2P02652 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA2P02652 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA2P02652 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA2P02652 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA2P02652 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA2P02652 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA2P02652 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA2P02652 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA2P02652 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA2P02652 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA2P02652 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA2P02652 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOA2P02652 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA2P02652 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA2P02652 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA2P02652 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA2P02652 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA2P02652 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA2P02652 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOA2P02652 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA2P02652 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA2P02652 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA2P02652 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA2P02652 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA2P02652 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA2P02652 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA2P02652 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA2P02652 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA2P02652 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA2P02652 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOA2P02652 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOA2P02652 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA2P02652 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA2P02652 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA2P02652 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA2P02652 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA2P02652 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA2P02652 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA2P02652 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA2P02652 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA2P02652 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA2P02652 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA2P02652 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA2P02652 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA2P02652 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA2P02652 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA2P02652 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA2P02652 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA2P02652 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA2P02652 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA2P02652 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA2P02652 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA2P02652 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA2P02652 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA2P02652 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA2P02652 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA2P02652 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA2P02652 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA2P02652 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA2P02652 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms