Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHEP01854 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHEP01854 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHEP01854 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHEP01854 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHEP01854 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHEP01854 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHEP01854 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHEP01854 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHEP01854 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHEP01854 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHEP01854 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHEP01854 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IGHEP01854 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGHEP01854 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGHEP01854 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGHEP01854 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGHEP01854 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGHEP01854 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGHEP01854 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IGHEP01854 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IGHEP01854 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IGHEP01854 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGHEP01854 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGHEP01854 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IGHEP01854 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IGHEP01854 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IGHEP01854 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGHEP01854 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGHEP01854 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHEP01854 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHEP01854 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHEP01854 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGHEP01854 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGHEP01854 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHEP01854 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHEP01854 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGHEP01854 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGHEP01854 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGHEP01854 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGHEP01854 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IGHEP01854 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGHEP01854 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IGHEP01854 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGHEP01854 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGHEP01854 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGHEP01854 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGHEP01854 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGHEP01854 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGHEP01854 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHEP01854 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHEP01854 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHEP01854 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHEP01854 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHEP01854 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGHEP01854 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGHEP01854 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGHEP01854 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGHEP01854 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGHEP01854 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGHEP01854 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGHEP01854 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGHEP01854 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGHEP01854 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGHEP01854 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHEP01854 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHEP01854 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHEP01854 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHEP01854 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHEP01854 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHEP01854 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHEP01854 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHEP01854 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHEP01854 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHEP01854 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHEP01854 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHEP01854 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHEP01854 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHEP01854 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHEP01854 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHEP01854 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGHEP01854 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGHEP01854 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGHEP01854 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGHEP01854 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGHEP01854 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGHEP01854 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGHEP01854 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGHEP01854 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGHEP01854 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGHEP01854 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGHEP01854 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGHEP01854 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGHEP01854 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IGHEP01854 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGHEP01854 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGHEP01854 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGHEP01854 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGHEP01854 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHEP01854 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms