Protein–RNA interactions for Protein: P00709

LALBA, Alpha-lactalbumin, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LALBAP00709 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LALBAP00709 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LALBAP00709 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LALBAP00709 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LALBAP00709 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LALBAP00709 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LALBAP00709 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LALBAP00709 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LALBAP00709 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LALBAP00709 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LALBAP00709 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LALBAP00709 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LALBAP00709 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LALBAP00709 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LALBAP00709 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LALBAP00709 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LALBAP00709 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LALBAP00709 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LALBAP00709 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LALBAP00709 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LALBAP00709 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LALBAP00709 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LALBAP00709 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LALBAP00709 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LALBAP00709 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LALBAP00709 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LALBAP00709 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LALBAP00709 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LALBAP00709 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LALBAP00709 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LALBAP00709 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LALBAP00709 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LALBAP00709 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LALBAP00709 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LALBAP00709 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LALBAP00709 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LALBAP00709 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LALBAP00709 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LALBAP00709 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LALBAP00709 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LALBAP00709 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LALBAP00709 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LALBAP00709 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LALBAP00709 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LALBAP00709 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LALBAP00709 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LALBAP00709 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LALBAP00709 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LALBAP00709 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LALBAP00709 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LALBAP00709 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LALBAP00709 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LALBAP00709 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LALBAP00709 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LALBAP00709 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LALBAP00709 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LALBAP00709 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LALBAP00709 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LALBAP00709 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LALBAP00709 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LALBAP00709 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LALBAP00709 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LALBAP00709 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LALBAP00709 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LALBAP00709 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LALBAP00709 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LALBAP00709 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LALBAP00709 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LALBAP00709 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LALBAP00709 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LALBAP00709 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LALBAP00709 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LALBAP00709 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LALBAP00709 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LALBAP00709 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LALBAP00709 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LALBAP00709 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LALBAP00709 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LALBAP00709 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LALBAP00709 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LALBAP00709 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LALBAP00709 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LALBAP00709 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LALBAP00709 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LALBAP00709 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LALBAP00709 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LALBAP00709 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LALBAP00709 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LALBAP00709 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LALBAP00709 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LALBAP00709 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LALBAP00709 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LALBAP00709 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LALBAP00709 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LALBAP00709 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LALBAP00709 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LALBAP00709 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LALBAP00709 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LALBAP00709 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LALBAP00709 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms