Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAL4O96015 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAL4O96015 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAL4O96015 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAL4O96015 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAL4O96015 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms