Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MBD3O95983 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MBD3O95983 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MBD3O95983 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MBD3O95983 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MBD3O95983 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
MBD3O95983 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MBD3O95983 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MBD3O95983 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MBD3O95983 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MBD3O95983 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MBD3O95983 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MBD3O95983 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MBD3O95983 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MBD3O95983 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MBD3O95983 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MBD3O95983 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MBD3O95983 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MBD3O95983 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MBD3O95983 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MBD3O95983 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD3O95983 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD3O95983 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD3O95983 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD3O95983 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD3O95983 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD3O95983 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD3O95983 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD3O95983 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD3O95983 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD3O95983 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD3O95983 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD3O95983 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MBD3O95983 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MBD3O95983 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MBD3O95983 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MBD3O95983 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MBD3O95983 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MBD3O95983 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MBD3O95983 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MBD3O95983 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MBD3O95983 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MBD3O95983 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MBD3O95983 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MBD3O95983 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MBD3O95983 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MBD3O95983 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MBD3O95983 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MBD3O95983 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MBD3O95983 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MBD3O95983 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MBD3O95983 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MBD3O95983 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MBD3O95983 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MBD3O95983 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MBD3O95983 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MBD3O95983 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MBD3O95983 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MBD3O95983 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MBD3O95983 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MBD3O95983 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MBD3O95983 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MBD3O95983 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MBD3O95983 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MBD3O95983 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD3O95983 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD3O95983 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD3O95983 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD3O95983 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD3O95983 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD3O95983 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MBD3O95983 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MBD3O95983 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD3O95983 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD3O95983 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD3O95983 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD3O95983 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD3O95983 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD3O95983 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD3O95983 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD3O95983 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD3O95983 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD3O95983 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD3O95983 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD3O95983 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD3O95983 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD3O95983 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD3O95983 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD3O95983 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD3O95983 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD3O95983 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD3O95983 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD3O95983 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD3O95983 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD3O95983 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD3O95983 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD3O95983 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD3O95983 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD3O95983 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD3O95983 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms