Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LCA5LO95447 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LCA5LO95447 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LCA5LO95447 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LCA5LO95447 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LCA5LO95447 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCA5LO95447 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCA5LO95447 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCA5LO95447 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCA5LO95447 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCA5LO95447 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCA5LO95447 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCA5LO95447 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LCA5LO95447 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LCA5LO95447 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCA5LO95447 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCA5LO95447 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LCA5LO95447 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCA5LO95447 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCA5LO95447 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCA5LO95447 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCA5LO95447 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LCA5LO95447 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LCA5LO95447 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LCA5LO95447 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCA5LO95447 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
LCA5LO95447 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LCA5LO95447 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms