Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCC1O94876 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCC1O94876 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCC1O94876 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCC1O94876 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMCC1O94876 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCC1O94876 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMCC1O94876 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms