Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM2O94769 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ECM2O94769 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ECM2O94769 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ECM2O94769 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ECM2O94769 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ECM2O94769 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ECM2O94769 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ECM2O94769 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ECM2O94769 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ECM2O94769 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ECM2O94769 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ECM2O94769 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ECM2O94769 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ECM2O94769 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ECM2O94769 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ECM2O94769 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ECM2O94769 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ECM2O94769 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ECM2O94769 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ECM2O94769 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ECM2O94769 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ECM2O94769 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ECM2O94769 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ECM2O94769 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM2O94769 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM2O94769 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM2O94769 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM2O94769 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM2O94769 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ECM2O94769 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ECM2O94769 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ECM2O94769 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ECM2O94769 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ECM2O94769 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ECM2O94769 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ECM2O94769 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ECM2O94769 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ECM2O94769 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ECM2O94769 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ECM2O94769 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ECM2O94769 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ECM2O94769 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ECM2O94769 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ECM2O94769 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ECM2O94769 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ECM2O94769 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ECM2O94769 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ECM2O94769 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ECM2O94769 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ECM2O94769 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ECM2O94769 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ECM2O94769 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ECM2O94769 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ECM2O94769 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ECM2O94769 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ECM2O94769 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ECM2O94769 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ECM2O94769 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ECM2O94769 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ECM2O94769 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ECM2O94769 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ECM2O94769 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ECM2O94769 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ECM2O94769 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ECM2O94769 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ECM2O94769 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ECM2O94769 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ECM2O94769 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ECM2O94769 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ECM2O94769 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ECM2O94769 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ECM2O94769 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ECM2O94769 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ECM2O94769 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ECM2O94769 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ECM2O94769 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ECM2O94769 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ECM2O94769 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ECM2O94769 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ECM2O94769 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ECM2O94769 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ECM2O94769 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ECM2O94769 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ECM2O94769 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ECM2O94769 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ECM2O94769 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ECM2O94769 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ECM2O94769 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ECM2O94769 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ECM2O94769 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ECM2O94769 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ECM2O94769 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ECM2O94769 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ECM2O94769 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ECM2O94769 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ECM2O94769 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ECM2O94769 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ECM2O94769 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ECM2O94769 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms