Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP2O75563 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SKAP2O75563 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP2O75563 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP2O75563 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP2O75563 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP2O75563 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.8 ms