Protein–RNA interactions for Protein: O75417

POLQ, DNA polymerase theta, humanhuman

Predictions only

Length 2,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLQO75417 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLQO75417 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLQO75417 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLQO75417 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLQO75417 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLQO75417 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLQO75417 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLQO75417 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLQO75417 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLQO75417 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLQO75417 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLQO75417 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLQO75417 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLQO75417 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLQO75417 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLQO75417 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLQO75417 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLQO75417 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLQO75417 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLQO75417 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLQO75417 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLQO75417 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLQO75417 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLQO75417 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLQO75417 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLQO75417 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLQO75417 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLQO75417 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLQO75417 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLQO75417 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLQO75417 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLQO75417 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLQO75417 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLQO75417 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLQO75417 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLQO75417 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLQO75417 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLQO75417 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLQO75417 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLQO75417 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLQO75417 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLQO75417 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLQO75417 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLQO75417 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLQO75417 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLQO75417 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLQO75417 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLQO75417 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLQO75417 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLQO75417 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLQO75417 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLQO75417 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLQO75417 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLQO75417 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLQO75417 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLQO75417 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLQO75417 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLQO75417 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLQO75417 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLQO75417 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLQO75417 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLQO75417 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLQO75417 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLQO75417 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLQO75417 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLQO75417 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLQO75417 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLQO75417 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLQO75417 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLQO75417 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLQO75417 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLQO75417 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLQO75417 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLQO75417 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLQO75417 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLQO75417 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLQO75417 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLQO75417 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLQO75417 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLQO75417 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLQO75417 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLQO75417 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLQO75417 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLQO75417 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLQO75417 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLQO75417 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLQO75417 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLQO75417 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLQO75417 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLQO75417 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLQO75417 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLQO75417 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLQO75417 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLQO75417 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLQO75417 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLQO75417 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLQO75417 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLQO75417 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLQO75417 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLQO75417 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms