Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
BRD4O60885 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
BRD4O60885 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
BRD4O60885 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
BRD4O60885 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
BRD4O60885 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
BRD4O60885 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
BRD4O60885 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BRD4O60885 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
BRD4O60885 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BRD4O60885 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
BRD4O60885 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
BRD4O60885 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BRD4O60885 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BRD4O60885 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BRD4O60885 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
BRD4O60885 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
BRD4O60885 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BRD4O60885 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
BRD4O60885 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
BRD4O60885 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
BRD4O60885 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
BRD4O60885 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
BRD4O60885 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
BRD4O60885 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
BRD4O60885 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
BRD4O60885 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
BRD4O60885 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
BRD4O60885 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
BRD4O60885 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
BRD4O60885 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
BRD4O60885 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
BRD4O60885 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BRD4O60885 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BRD4O60885 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BRD4O60885 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
BRD4O60885 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
BRD4O60885 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
BRD4O60885 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
BRD4O60885 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
BRD4O60885 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
BRD4O60885 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BRD4O60885 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BRD4O60885 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
BRD4O60885 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
BRD4O60885 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BRD4O60885 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BRD4O60885 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
BRD4O60885 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BRD4O60885 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
BRD4O60885 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
BRD4O60885 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
BRD4O60885 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
BRD4O60885 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
BRD4O60885 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
BRD4O60885 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
BRD4O60885 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
BRD4O60885 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BRD4O60885 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BRD4O60885 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BRD4O60885 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
BRD4O60885 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
BRD4O60885 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
BRD4O60885 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
BRD4O60885 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
BRD4O60885 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
BRD4O60885 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
BRD4O60885 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
BRD4O60885 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
BRD4O60885 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
BRD4O60885 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
BRD4O60885 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
BRD4O60885 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
BRD4O60885 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
BRD4O60885 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
BRD4O60885 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
BRD4O60885 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
BRD4O60885 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
BRD4O60885 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
BRD4O60885 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BRD4O60885 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
BRD4O60885 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
BRD4O60885 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BRD4O60885 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BRD4O60885 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BRD4O60885 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
BRD4O60885 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BRD4O60885 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
BRD4O60885 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
BRD4O60885 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
BRD4O60885 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
BRD4O60885 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
BRD4O60885 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BRD4O60885 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BRD4O60885 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
BRD4O60885 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BRD4O60885 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BRD4O60885 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
BRD4O60885 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
BRD4O60885 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms