Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC54.6■■■■■ 6.33
ABCC9O60706 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.59■■■■■ 6.33
ABCC9O60706 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.58■■■■■ 6.33
ABCC9O60706 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC54.56■■■■■ 6.32
ABCC9O60706 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC54.54■■■■■ 6.32
ABCC9O60706 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.52■■■■■ 6.32
ABCC9O60706 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC54.52■■■■■ 6.32
ABCC9O60706 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC54.52■■■■■ 6.32
ABCC9O60706 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.52■■■■■ 6.32
ABCC9O60706 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.52■■■■■ 6.32
ABCC9O60706 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC54.5■■■■■ 6.31
ABCC9O60706 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
ABCC9O60706 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC54.48■■■■■ 6.31
ABCC9O60706 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC54.48■■■■■ 6.31
ABCC9O60706 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC54.48■■■■■ 6.31
ABCC9O60706 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC54.47■■■■■ 6.31
ABCC9O60706 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.46■■■■■ 6.31
ABCC9O60706 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.46■■■■■ 6.31
ABCC9O60706 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC54.45■■■■■ 6.31
ABCC9O60706 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.45■■■■■ 6.31
ABCC9O60706 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC54.44■■■■■ 6.31
ABCC9O60706 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.44■■■■■ 6.3
ABCC9O60706 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
ABCC9O60706 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.42■■■■■ 6.3
ABCC9O60706 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC54.42■■■■■ 6.3
ABCC9O60706 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.42■■■■■ 6.3
ABCC9O60706 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.41■■■■■ 6.3
ABCC9O60706 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.41■■■■■ 6.3
ABCC9O60706 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC54.41■■■■■ 6.3
ABCC9O60706 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC54.4■■■■■ 6.3
ABCC9O60706 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.37■■■■■ 6.29
ABCC9O60706 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.37■■■■■ 6.29
ABCC9O60706 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.35■■■■■ 6.29
ABCC9O60706 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC54.35■■■■■ 6.29
ABCC9O60706 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC54.34■■■■■ 6.29
ABCC9O60706 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC54.34■■■■■ 6.29
ABCC9O60706 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.33■■■■■ 6.29
ABCC9O60706 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.3■■■■■ 6.28
ABCC9O60706 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
ABCC9O60706 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC54.27■■■■■ 6.28
ABCC9O60706 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.27■■■■■ 6.28
ABCC9O60706 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC54.24■■■■■ 6.27
ABCC9O60706 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC54.24■■■■■ 6.27
ABCC9O60706 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC54.23■■■■■ 6.27
ABCC9O60706 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC54.21■■■■■ 6.27
ABCC9O60706 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC54.2■■■■■ 6.27
ABCC9O60706 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.18■■■■■ 6.26
ABCC9O60706 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC54.16■■■■■ 6.26
ABCC9O60706 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC54.15■■■■■ 6.26
ABCC9O60706 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC54.14■■■■■ 6.26
ABCC9O60706 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC54.13■■■■■ 6.26
ABCC9O60706 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC54.11■■■■■ 6.25
ABCC9O60706 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.11■■■■■ 6.25
ABCC9O60706 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC54.09■■■■■ 6.25
ABCC9O60706 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC54.08■■■■■ 6.25
ABCC9O60706 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.08■■■■■ 6.25
ABCC9O60706 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC54.08■■■■■ 6.25
ABCC9O60706 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC54.07■■■■■ 6.25
ABCC9O60706 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.25
ABCC9O60706 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC54.05■■■■■ 6.24
ABCC9O60706 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.03■■■■■ 6.24
ABCC9O60706 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.02■■■■■ 6.24
ABCC9O60706 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC54.01■■■■■ 6.24
ABCC9O60706 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.99■■■■■ 6.23
ABCC9O60706 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.99■■■■■ 6.23
ABCC9O60706 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC53.98■■■■■ 6.23
ABCC9O60706 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC53.97■■■■■ 6.23
ABCC9O60706 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC53.97■■■■■ 6.23
ABCC9O60706 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC53.97■■■■■ 6.23
ABCC9O60706 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC53.97■■■■■ 6.23
ABCC9O60706 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
ABCC9O60706 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.94■■■■■ 6.23
ABCC9O60706 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC53.93■■■■■ 6.22
ABCC9O60706 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.91■■■■■ 6.22
ABCC9O60706 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC53.9■■■■■ 6.22
ABCC9O60706 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC53.89■■■■■ 6.22
ABCC9O60706 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.89■■■■■ 6.22
ABCC9O60706 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC53.87■■■■■ 6.21
ABCC9O60706 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC53.86■■■■■ 6.21
ABCC9O60706 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC53.86■■■■■ 6.21
ABCC9O60706 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC53.85■■■■■ 6.21
ABCC9O60706 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC53.84■■■■■ 6.21
ABCC9O60706 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC53.84■■■■■ 6.21
ABCC9O60706 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC53.83■■■■■ 6.21
ABCC9O60706 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC53.82■■■■■ 6.21
ABCC9O60706 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC53.8■■■■■ 6.2
ABCC9O60706 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.78■■■■■ 6.2
ABCC9O60706 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC53.77■■■■■ 6.2
ABCC9O60706 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.76■■■■■ 6.2
ABCC9O60706 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC53.76■■■■■ 6.2
ABCC9O60706 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC53.76■■■■■ 6.2
ABCC9O60706 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC53.76■■■■■ 6.2
ABCC9O60706 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.75■■■■■ 6.2
ABCC9O60706 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC53.73■■■■■ 6.19
ABCC9O60706 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC53.73■■■■■ 6.19
ABCC9O60706 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
ABCC9O60706 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC53.72■■■■■ 6.19
ABCC9O60706 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
ABCC9O60706 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.69■■■■■ 6.19
ABCC9O60706 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC53.69■■■■■ 6.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms