Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
LY75O60449 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
LY75O60449 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
LY75O60449 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LY75O60449 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LY75O60449 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
LY75O60449 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LY75O60449 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LY75O60449 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LY75O60449 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LY75O60449 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LY75O60449 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LY75O60449 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LY75O60449 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LY75O60449 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LY75O60449 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LY75O60449 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LY75O60449 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LY75O60449 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LY75O60449 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LY75O60449 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LY75O60449 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LY75O60449 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LY75O60449 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LY75O60449 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LY75O60449 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LY75O60449 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LY75O60449 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LY75O60449 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LY75O60449 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LY75O60449 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LY75O60449 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LY75O60449 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LY75O60449 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LY75O60449 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LY75O60449 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LY75O60449 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LY75O60449 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LY75O60449 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LY75O60449 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LY75O60449 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LY75O60449 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
LY75O60449 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LY75O60449 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LY75O60449 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LY75O60449 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LY75O60449 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LY75O60449 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LY75O60449 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LY75O60449 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LY75O60449 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LY75O60449 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LY75O60449 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LY75O60449 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LY75O60449 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LY75O60449 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LY75O60449 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LY75O60449 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LY75O60449 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LY75O60449 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LY75O60449 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LY75O60449 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LY75O60449 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LY75O60449 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LY75O60449 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LY75O60449 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LY75O60449 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LY75O60449 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
LY75O60449 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LY75O60449 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LY75O60449 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LY75O60449 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LY75O60449 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LY75O60449 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LY75O60449 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LY75O60449 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LY75O60449 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LY75O60449 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LY75O60449 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LY75O60449 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LY75O60449 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LY75O60449 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
LY75O60449 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LY75O60449 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LY75O60449 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LY75O60449 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LY75O60449 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LY75O60449 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LY75O60449 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
LY75O60449 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LY75O60449 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
LY75O60449 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LY75O60449 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LY75O60449 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LY75O60449 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LY75O60449 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LY75O60449 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LY75O60449 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LY75O60449 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LY75O60449 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms